- Algoritmo per assemblare long reads in grafi di splicing
- Algoritmo per allineare long reads ad uno splicing graph
- Costruzione di grafi di variazione
- ALPACA
- PhD position available
- Pangaia
- First Workshop On Pangenomics Algorithms for Omics Data
- Stage: Paralellizazione algoritmo di Simulated Annealing per inferenza di progressioni tumorali
- Stage: Ottimizzazione algoritmo di Maximum Likelihood per inferenza di progressioni tumorali
- Algolab at ICCABS 2018
- Algolab at Recomb 2018
- Advanced Techniques for Combinatorial Algorithms (2018)
- Workshop on Combinatorial Algorithms in Bioinformatics
- AlgoDay 2017
- Special session on Algorithmics for biology
- Invited talk at CiE 2017
- Workshop on Graph Assembly Algorithms for omics data
- Tesi: Algoritmi per l’assemblaggio di multiple stringhe di DNA
- Tesi: Euristiche applicate all’assemblaggio di aplotipi
- Tesi: Algoritmi di indicizzazione del grafo del pangenoma
- Advanced Techniques for Combinatorial Algorithms
- An in-silico framework for comparing and validating transcripts predicted from single and paired-end reads
- Detection of long noncoding (lncRNA) involved in RNA-Seq isoforms
- Stage Interno: Diff da Allineamento
- Stage Esterno: Gestione di configurazioni Docker
- Stage Esterno: Gestione di sistemi di deployment basati su Docker in infrastrutture vincolate
- Metodi algoritmici e modelli: aspetti teorici e applicazioni in bioinformatica
- Covering pairs in directed acyclic graphs
- Tesi Esterna: Analisi della variazione di affinità miRNA::target causata da SNP
- Grant: Modulation of anti-cancer immune response by regulatory non-coding RNAs
- Algoritmi e modelli computazionali: aspetti teorici e applicazioni nelle scienze della vita
- Stage Esterno: Il web semantico per i dati di sequenziamento
- Stage Esterno: YAScttr : Yet Another Scutter
- Stage Esterno: YABioPipe: Bioinformatics pipelines for everyone
- Stage Esterno: Clinic Meets Research: una applicazione web per la gestione dei dati clinici usati nella ricerca
- Stage Interno: valutazione di programmi per il calcolo della trasformata di Burrows-Wheeler
- Stage Interno: Rifattorizzazione programma per il calcolo di splicing alternativo
- Stage Interno: Confronto di approcci per lo spliced alignment
- Stage Interno: Sviluppo applicazione web per indentificazione di splicing alternativi
- Grant: Automi e Linguaggi Formali: Aspetti Matematici e Applicativi
- Combinatorial Structures for Sequence Analysis in Bioinformatics
- Our Git branching model
- Computatibility in Europe 2013
- Haplotype-based prediction of gene alleles using pedigrees and SNP genotypes
- Basic Algorithmic Aspects of NGS data analysis
- A fast and practical approach to genotype phasing and imputation on a pedigree with erroneous and incomplete information
- Incontro di Presentazione di Stage e Tesi
- Ph.D. course: Massive data analysis in the Web and post-genomic era
- Incontro di Presentazione di Stage e Tesi
- Tesi: Creazione di un’applicazione Rails per l’annotazione e condivisione di dati e informazioni Immunologiche
- Stage: Puppet per il provisioning in ambiente virtualizzato – cloud
- Tesi: Sviluppo ed estensione della API per il database Ensembl
- Stage: Creazione di un’applicazione in Rails per creare automaticamente sistemi di data warehouse per dati biologici.
- Analisi sperimentale di algoritmi di clustering
- Realizzazione di un database per la gestione di informazioni genomiche
- PIntron: a fast method for gene structure prediction via maximal pairings of a pattern and a text
- A Novel Perspective in Algorithmic Combinatorial Methods for Phasing Populations in a Coalescent Model
- Haplotype Inference on Pedigrees with Recombinations and Mutations
- Colloquium on Unconventional models of Computation
- Pure Parsimony Xor Haplotyping
- Minimum Factorization Agreement of Spliced ESTs
- ASWorkshop