Archives

Descrizione PIntron è un programma sviluppato dal nostro gruppo di ricerca per il calcolo della struttura esoni-introni di un gene. Questo software viene attualmente utilizzato per alimentare uno dei principali database biologici  dedicati agli effetti del fenomeno biologico chiamato splicing alternativo. Per adattare questo software ai dati derivanti dalle nuove tecnologie di sequenziamento, diventa necessario […]

Descrizione Il problema dello spliced alignment consiste nel allineare una porzione di trascritto con un genoma di riferimento. II programma che affronta questo problema viene detto spliced aligner e realizza uno dei passi principali di un sistema di predizione di splicing alternativo: PIntron.  L’obiettivo dello stage consiste nel sostituire in PIntron lo spliced aligner attualmente […]

Descrizione Vogliamo realizzare un’applicazione web che si interfacci ad un software esistente (PIntron) che predice la struttura esoni-introni di un gene. Questo software viene attualmente utilizzato per alimentare uno dei principali database biologici  dedicati agli effetti del fenomeno biologico chiamato splicing alternativo. L’obiettivo dello stage consiste nella creazione di una interfaccia web per utilizzare il […]