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Stage Interno: valutazione di programmi per il calcolo della trasformata di Burrows-Wheeler

Descrizione LightStringGraph è un programma sviluppato dal nostro gruppo di ricerca per l’assemblaggio del genoma a partire da dati derivanti dalle nuove tecnologie di sequenziamento. Questo programma è basato sull’algoritmo chiamato trasformata di Burrows-Wheeler, e incorpora un programma che implementa tale algoritmo. Recentemente è stata proposta una nuova implementazione alternativa: ropebwt. Questo stage ha come […]

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