Il gruppo di ricerca AlgoLab (http://www.algolab.eu/), principalmente associato con il laboratorio di Bioinformatica e Calcolo Naturale, propone Stage e Tesi riguardanti la gestione e analisi di grandi quantità di dati (big data analysis). Le proposte permettono agli studenti di acquisire competenze e conoscenze spendibili in ogni ambito professionale, quali Ruby, Ruby on Rails, Hadoop, Puppet, […]
Read MoreIl gruppo di ricerca AlgoLab (http://www.algolab.eu/), principalmente associato con il laboratorio di Bioinformatica e Calcolo Naturale, propone Stage e Tesi riguardanti la gestione e analisi di grandi quantità di dati (big data analysis). Le proposte permettono agli studenti di acquisire competenze e conoscenze spendibili in ogni ambito professionale, quali Ruby, Ruby on Rails, Hadoop, Puppet, […]
Read MoreDescrizione Il nostro centro di ricerca ha come risorsa strategica la conoscenza immunologica derivante dall’esperienza dei ricercatori e dalle informazioni che ogni giorno altri laboratori producono sotto forma di articoli scientifici. Diversi database pubblici descrivono gran parte della conoscenza oggi disponibile ma non possono descrivere in dettaglio i singoli esperimenti che vengono condotti e soprattutto […]
Read MoreDescrizione Un laboratorio di Bioinformatica è un ambiente dinamico dove nuovi software, librerie e strumenti in genere devono essere aggiornati e disponibili in breve tempo. Inoltre, la possibilità di costruire in casa un sistema Cloud consente di avere un numero variabile di istanze di macchine che devono essere amministrate in modo dinamico. La gestione di […]
Read MoreDescrizione Il database Ensembl (www.ensembl.org) è uno dei principali database pubblici a livello mondiale che contiene informazioni sulle sequenze genomiche e relativi dati biologici delle principali specie oggetto di studio. L’API storica e ufficiale del database Ensembl è sviluppata da EBI (European Bioinformatics Institute, www.ebi.ac.uk) nel linguaggio Perl. In un processo di aggiornamento e di […]
Read MoreNell’ambito dei diversi progetti di ricerca attivi, vi è la necessità di sviluppare un sistema di data warehousing, che possa gestire ed immagazzinare i dati prodotti dalle nuove tecnologie di sequenziamento del genoma. Questo sistema dovrà rispondere a diverse caratteristiche, tra cui flessibilità e scalabilità per adattarsi alle grandi quantità di dati (centinaia di gigabyte) […]
Read MoreIl problema del clustering è uno dei più comuni in Informatica e consiste nel raggruppare elementi “simili” di un insieme, data una opportuna nozione di similarità. Abbiamo disegnato alcuni algoritmi ed effettuato un’analisi di natura teorica per tali algoritmi. Siamo interessati ad implementarli e a analizzare sperimentalmente la bontà di tali algoritmi.
Read MoreLo splicing alternativo è il meccanismo biologico che espande la complessità del proteoma negli organismi multicellulari. PIntron è un progetto di ricerca, sviluppato all’interno del laboratorio, che si occupa di sviluppare strumenti software per la predizione di eventi di splicing alternativo. L’obiettivo della tesi consiste nel disegnare una base di dati per la memorizzazione di […]
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