Descrizione
PIntron è un programma sviluppato dal nostro gruppo di ricerca per il calcolo della struttura esoni-introni di un gene. Questo software viene attualmente utilizzato per alimentare uno dei principali database biologici dedicati agli effetti del fenomeno biologico chiamato splicing alternativo.
Per adattare questo software ai dati derivanti dalle nuove tecnologie di sequenziamento, diventa necessario pensare una rifattorizzazione del codice ed alla preparazione di un insieme di test (di regressione e unit test) per evitare di compromettere la qualità delle predizioni.
Luogo
DISCo – Unimib
Requisiti
Conoscenze basilari del linguaggio di programmazione C e di test dei programmi.
Competenze acquisibili
Capacità di lavorare su programmi scritti in C. Capacità di usare un sistema di controllo di versione (git). Capacità di relazionarsi con persone aventi competenze eterogenee, lavoro di team, tempistiche di consegna e valutazione di fattibilità.
Risultati attesi
Aggiornamento del programma PIntron. Realizzazione di una sperimentazione per valutare le modifiche apprortate.
Per informazioni contattare
Gianluca Della Vedova <gianluca.dellavedova@unimib.it> o Raffaella Rizzi <raffaella.rizzi@unimib.it>
Tempo di realizzazione
3 mesi